Nem todas as bactérias são prejudiciais aos seres humanos. Um exemplo de bactérias benéficas é Lactobacillus GG. Estes também são conhecidos como probióticos, e ajudar na digestão, limitando a quantidade de bactérias nocivas no cólon. No entanto, existem bactérias ruins, encontrado fora do corpo, que não só são prejudiciais aos seres humanos, mas também mortal. Algumas destas bactérias são encontradas na água do rio.
Dr. Charles L. Stoltenow, um veterinário de extensão na Universidade Estadual de Dakota do Norte, escreveu um artigo sobre o envenenamento de cianobactérias em animais que têm bebido água que contém uma ou mais espécies de cianobactérias. De acordo com Dr. Stoltenow, cianobactérias, também conhecidas como algas azuis-verdes, pode causar convulsões, diarreia com sangue e morte súbita em animais afetados. As cianobactérias são bactérias fotossintéticas, o que significa que eles utilizam a energia do sol para a produção de material orgânico. A fotossíntese é também a forma como eles obtêm a sua marca registrada, pigmento azul-esverdeado. Cianobactérias, que são encontrados em muitos corpos de água, incluindo a água do rio, produzir "compostos sabor e odor." Segundo a equipe de Toxin Research USGS Kansas algas estes compostos cianobactérias foram relatados para causar doenças e até a morte em humanos e animais, em pelo menos 35 estados dos EUA.
infecção por Yersinia enterocolitica é normalmente atribuído ao consumo de carne de porco crua ou mal cozida, e produtos de carne de porco. No entanto, a Yersinia enterocolitica também pode ser transmitida para animais e seres humanos na água do rio fortemente contaminado. Os sintomas da infecção incluem febre, dor abdominal e diarreia com sangue. De acordo com um estudo de 1980 publicado pelo Microbiologia atual iournal internacional, Vol. 4, 24 estirpes isoladas da Yersinia enterocolitica foram identificados a partir de 46 amostras de água tomadas a partir de pequenas rios em toda a Bélgica. Estas estirpes apresentaram características, que foram bioquímicas e serológicas na natureza, o que significa que a contaminação de bactérias foi o resultado directo de matéria biológica.
Microrganismos, tais como bactérias coliformes Escherichia coli e estreptococos, são encontrados na água do rio para um número de razões. Os animais em pastoreio pode defecar em rios ou próximo, o que pode contribuir para uma elevada concentração de bactérias fecais. Outras maneiras estas bactérias podem entrar um sistema de rio ou fonte de água do rio é através de bueiros e sistemas de esgoto com defeito ou recipientes, como um estouro de esgoto público ou um vazamento de tanque séptico. Nos seres humanos, as bactérias estreptococos podem provocar glomerulonefrite reumática febril aguda (doença renal) - escarlate bactérias febril sepsia, chamado Bacteremia- e síndrome do choque tóxico. bactérias coliformes humanos envenenamento pode causar cólicas, diarreia, e em alguns casos de outras doenças transmitidas pela água.
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